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La respiration microbienne océanique est considérée comme le principal processus de l'oxydation biologique de la matičre organique (MO). Elle produit du CO2 métabolique estimé ŕ environ 22 Pg C a-1. Les intensités respiratoires in situ sont généralement trop faibles (de plusieurs ordres de grandeur) pour ętre accessibles aux méthodes de mesure directes. Des sondes fluorescentes, comme le DiOC6(3) sont trčs sensibles ŕ l'intensité de la différence de potentiel électrochimique du proton żµH+ qui caractérise les membranes plasmiques qui portent le systčme respiratoire chez les cellules procaryotes. Chez les mitochondries, le żµH+ présente une relation linéaire avec le flux d'oxygčne. Les travaux de G. Grégori ont mis en évidence une relation linéaire entre la vitesse de respiration de D. tertiolecta et son intensité de fluorescence verte spécifique induite par le DiOC6(3). Il est donc possible de mesurer par cytométrie de flux la vitesse de respiration de la souche. A présent il s'agit d'étendre la méthode aux procaryotes hétérotrophes, principaux acteurs de la minéralisation de la MO dans l'océan. sont présentés dans cet ouvrage les résultats obtenus sur l'eubactérie P.nautica 617